為做好2025年江門市病原宏基因及細菌全基因組等測序工作,現(xiàn)向社會廣泛征集測序服務提供單位,現(xiàn)將有關(guān)事項公告如下:
一、項目內(nèi)容
對相關(guān)樣本開展病原宏基因組、細菌全基因組測序及病原一代測序服務。
二、服務機構(gòu)資質(zhì)要求
(一)參加單位符合《中華人民共和國政府采購法》第二十二條的規(guī)定。
(二)在中華人民共和國境內(nèi)注冊的具有獨立承擔民事責任的法人或其他組織,并獲得工商營業(yè)執(zhí)照。
(三)投標人須具備相關(guān)服務的資質(zhì)或者獲得具有相關(guān)資質(zhì)單位的授權(quán),提供相關(guān)資質(zhì)證明和授權(quán)文件。
三、提交材料
(一)提供在中華人民共和國境內(nèi)注冊的法人或其他組織的營業(yè)執(zhí)照或事業(yè)單位法人證書或社會團體法人登記證書復印件。
(二)提供測序服務的資質(zhì)或者獲得具有相關(guān)資質(zhì)單位的授權(quán),提供相關(guān)資質(zhì)證明和授權(quán)文件。
(三)相關(guān)項目與3家以上相關(guān)單位的科室有合作,每家單位提供一份合作協(xié)議及檢測報告作為證明。
四、項目內(nèi)容說明
(一)項目目標
1、為進一步加強我市病原監(jiān)測、鑒定和分析預警,及時掌握我市病原特征和流行態(tài)勢,為傳染病的發(fā)現(xiàn)、識別、疫情預警提供科學依據(jù)。
(二)標本接收
1、服務供應商承擔本項目所有樣本轉(zhuǎn)運物流工作,提供可查詢的物流運輸,確保樣本運輸?shù)臅r效性、安全性,并要求送檢樣本符合相關(guān)檢測對樣本質(zhì)量的要求。
2、服務供應商應制定具體的物流方案,規(guī)范標本接收、登記流程,確保標本順利交接,方便核查。
3、服務供應商須按照標本必需的條件進行運輸,收取標本時,應核對標本信息,仔細檢查標記、封口、數(shù)量等以保證符合檢測的要求,確認無誤后方可接收標本。妥善運輸、處理和保存標本,保證標本質(zhì)量和安全,防止出現(xiàn)標本丟失、傾瀉、破裂等事故。
4、服務供應商須制定相應的保密工作程序,保證標本的相關(guān)信息及資料保密工作。
五、樣本檢測與要求
(一)病原一代測序技術(shù)服務
1、采購數(shù)量:50份,最高限價60元/樣本。
2、技術(shù)要求:
(1)要求使用一代測序平臺,對送檢的樣本進行sanger法測序。
(2)要求對被檢樣品進行核酸提取、反轉(zhuǎn)錄和巢式PCR擴增,并對擴增產(chǎn)物進行一代測序和結(jié)果處理分析。
(3)要求對擴增后的PCR產(chǎn)物純化后直接測序,若一次測序結(jié)果不理想,需技術(shù)分析后進行優(yōu)化測序。
▲(4)數(shù)據(jù)分析:要求對測序產(chǎn)生的數(shù)據(jù)進行基因系統(tǒng)進化和耐藥位點分析并提供分析報告。
▲(5)可接受不定時分批送樣,為保證報告周期,從下單開始計算,24小時內(nèi)完成收樣、檢測與報告發(fā)放。檢測原始數(shù)據(jù)需48小時內(nèi)報送到投標人。(需提供書面承諾函并加蓋公章)
▲(6)相關(guān)項目(一代測序分析項目)與不少于3家以上醫(yī)療防控單位有合作,每家單位提供一份合作協(xié)議作為證明。
(7)檢測標本類型為痰、腦脊液、肺泡灌洗液、血液、糞便、或分離后的菌株等,供應商需提供采樣說明以及采樣要求和運輸要求說明。
(8)服務供應商需提供本項目中所提及的完整測序方案及檢測過程中的質(zhì)控方案。
(9)具有優(yōu)秀的質(zhì)量保證體系和工作流程,控制高通量測序過程中出現(xiàn)的樣本混淆情況。結(jié)賬時只支付檢測成功的樣本費用。
(二)細菌全基因組測序服務
1、采購數(shù)量:60份,最高限價450元/株。
2、技術(shù)要求:
(1)要求對送檢的樣本進行核酸提取,并進行菌種鑒定,對符合要求的樣本進行二代測序。
▲(2)要求使用Illumina高通量測序平臺進行測序,測序讀長為2X150bp及以上;測序的原始數(shù)據(jù)量(堿基數(shù))≥5G;堿基數(shù)據(jù)質(zhì)量值Q30比例≥85%;Q20有效數(shù)據(jù)量(Clean data)≥1G。
▲(3)要求對新測序的基因組進行初步序列組裝和編碼基因預測,并進行基本病原特征分析,如毒力基因,耐藥基因及MLST分型等。(投標人需提供書面承諾書)
▲(4)可接受不定時分批送樣,為保證報告周期,從下單開始計算,10天內(nèi)完成收樣、檢測與個性化分析報告、原始數(shù)據(jù)和拼接數(shù)據(jù)的發(fā)放。(投標人需提供書面承諾書)
(5)能提供3次售后分析機會,能提供個性化作圖,能提供對應的技術(shù)指導。
(6)為保證檢測質(zhì)量和售后服務,檢測機構(gòu)具有針對病原宏基因組或致病菌高通量檢測項目檢測技術(shù)的能力,提供證明資料。
(7)投標人承擔本項目所有樣本轉(zhuǎn)運物流工作,提供可查詢的物流運輸,確保樣本運輸?shù)臅r效性、安全性,并要求送檢樣本符合相關(guān)檢測對樣本質(zhì)量的要求。
▲(8)相關(guān)項目(細菌二代高通量檢測)與3家以上相關(guān)單位的科室有合作,每家單位提供一份合作協(xié)議及檢測報告作為證明。
▲(9)服務供應商配備專門的服務團隊,對發(fā)放后的報告進行解讀,并安排分析人員上門為期兩周的個性化分析結(jié)果及方法進行培訓,使用者若有需求,可以2小時內(nèi)到達,處理客戶相關(guān)的數(shù)據(jù)問題。
(三)宏基因組測序分析服務
1、采購數(shù)量:60份,最高限價800元/樣本。
2、技術(shù)要求:
(1)提取:有針對各類樣本對應的DNA提取試劑盒/CTAB法/SDS法,進行基因組DNA抽提后,有處理特殊標本的能力,利用Thermo NanoDrop One檢測DNA的純度和濃度。
(2)建庫:按照Illumina標準流程進行建庫操作。
▲(3)測序:使用 Illumina Nova 6000平臺對構(gòu)建的擴增子文庫進行PE150測序,保證每個樣本的下機測序數(shù)據(jù)量≥60G。(投標人需提供書面承諾書)
(4)分析:對原始數(shù)據(jù)過濾拼接,通過MetaPhlAn3及HUMAnN3注釋及功能注釋,同時可以對特定的序列進行定量分析。有云平臺分析系統(tǒng),包括OUT聚類物種注釋,物種群落分析,alpha多樣性分析,beta多樣性分析,物種差異分析,環(huán)境因子關(guān)聯(lián)分析,菌群功能分析,菌群和環(huán)境暴露網(wǎng)絡分析,中介效應分析。
(5)能提供3次售后分析機會,能提供個性化作圖,能提供對應的技術(shù)指導。
▲(6)可接受不定時分批送樣,為保證報告周期,從下單開始計算,10天內(nèi)完成收樣、檢測與個性化分析報告、原始數(shù)據(jù)的發(fā)放。(投標人需提供書面承諾書)
(7)為保證檢測質(zhì)量和售后服務,檢測機構(gòu)具有針對病原宏基因組或致病菌高通量檢測項目檢測技術(shù)的能力,提供證明資料。
(8)投標人承擔本項目所有樣本轉(zhuǎn)運物流工作,提供可查詢的物流運輸,確保樣本運輸?shù)臅r效性、安全性,并要求送檢樣本符合相關(guān)檢測對樣本質(zhì)量的要求。
▲(9)相關(guān)項目(細菌二代高通量檢測)與3家以上相關(guān)單位的科室有合作,每家單位提供一份合作協(xié)議及檢測報告作為證明。
▲(10)服務供應商配備專門的服務團隊,對發(fā)放后的報告進行解讀,并安排分析人員上門為期兩周的個性化分析結(jié)果及方法進行培訓,使用者若有需求,可以2小時內(nèi)到達,處理客戶相關(guān)的數(shù)據(jù)問題。
(四)項目實施要求
1、項目期間對采購方提供的樣本完成宏基因測序60份,細菌全基因測序60份,病原一代測序50份。上述三個項目檢測份數(shù)可根據(jù)采購方實際工作需要調(diào)整,價格按實際成交價折算,直至完成合同總價服務終止。
2、必須對相關(guān)數(shù)據(jù)信息保密,不得向除采購人外的任何單位與個人透露,否則取消其中標資格;如造成經(jīng)濟損失及不良影響的,追究其經(jīng)濟賠償責任和法律責任。
3、服務供應商配備專門的服務團隊,對發(fā)放后的報告進行解讀。
4、樣本管理:服務方保證對采購方委托標本僅進行委托項目檢測,不作其他任何用途(如贈予他人或開展科學研究等),并保證在檢測完成后將委托標本按生物安全有關(guān)要求全部銷毀。
5、結(jié)果報告:
(1)服務供應商須滿足采購人對報告的特殊要求,將檢驗報告及檢驗結(jié)果匯總表及時發(fā)送到指定地點。
(2)服務供應商有完善的檢驗報告出現(xiàn)異常情況的處理流程。
(3)服務供應商保證所出具的檢驗報告具有法律效力。
6、監(jiān)督管理:
(1)服務供應商應建立相應的管理制度、管理架構(gòu),制定符合本項目要求的各項管理服務質(zhì)量指標。
(2)服務供應商必須保存好每批標本檢測實驗原始記錄,包括樣品編號、結(jié)果數(shù)據(jù)、檢測日期、檢測方法、質(zhì)量控制、試劑生產(chǎn)廠家/批號/有效期、環(huán)境溫度/濕度、操作者/復核者等,并接受采購人的各項監(jiān)督和檢查,包括不定期上門監(jiān)督管理,對采購人提出的合理意見必須及時做出有效響應。
(五)經(jīng)費說明
本項目設(shè)置最高總價為人民幣拾萬元整(78000元),以轉(zhuǎn)賬形式支付。
六、申請材料報送截止時間和方式
(一)申請材料報送截止日期:2025年9月16日。
(二)報送方式:按照本公告第三條要求提交報名材料,一式五份寄送到江門市蓬江區(qū)星河路10號江門市疾控中心。公示期限為5個工作日,接受社會各界有意向的服務單位報名。時間截止后不再受理其他報名。
七、聯(lián)系方式
聯(lián)系人:梁先生,聯(lián)系電話:0750-3288580;
地址:江門市蓬江區(qū)星河路10號。
江門市衛(wèi)生健康局
2025年9月10日
江門市政府門戶網(wǎng)站

粵公網(wǎng)安備 44070302000670

